Cepsa ha conseguido que todas sus refinerías y plantas petroquímicas ubicadas en España cumplan con el Plan Nacional de Asignación de Derechos de Emisión, por lo que disponen de la Autorización Ambiental Integrada (AAI), según recoge el Informe de Responsabilidad Corporativa de la compañía correspondiente al ejercicio 2008. La AAI certifica la implantación de programas de detección y reparación de fugas de COVs (compuestos orgánicos volátiles), la ampliación de la Planta de Tratamientos de Aguas y de la Red de Vigilancia y Control de la calidad del Aire, el aumento de eficiencia de recuperación en las Plantas de Azufre y el estudio para el aumento de recuperación de gas de antorcha.